Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4K2AP48426 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms