Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACADSBP45954 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACADSBP45954 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms