Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGDSP41222 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGDSP41222 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms