Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MDH1P40925 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MDH1P40925 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MDH1P40925 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms