Protein–RNA interactions for Protein: P39905

GDNF, Glial cell line-derived neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDNFP39905 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GDNFP39905 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDNFP39905 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDNFP39905 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDNFP39905 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDNFP39905 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDNFP39905 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDNFP39905 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDNFP39905 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDNFP39905 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDNFP39905 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDNFP39905 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDNFP39905 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDNFP39905 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDNFP39905 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDNFP39905 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDNFP39905 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDNFP39905 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDNFP39905 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDNFP39905 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDNFP39905 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDNFP39905 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GDNFP39905 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDNFP39905 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDNFP39905 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDNFP39905 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDNFP39905 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDNFP39905 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDNFP39905 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDNFP39905 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GDNFP39905 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms