Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNA7P36544 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms