Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD13P35453 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms