Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPC1P35052 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPC1P35052 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPC1P35052 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPC1P35052 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPC1P35052 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPC1P35052 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPC1P35052 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPC1P35052 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPC1P35052 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPC1P35052 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPC1P35052 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPC1P35052 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPC1P35052 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPC1P35052 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPC1P35052 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPC1P35052 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPC1P35052 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GPC1P35052 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPC1P35052 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPC1P35052 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPC1P35052 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPC1P35052 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPC1P35052 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPC1P35052 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPC1P35052 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GPC1P35052 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GPC1P35052 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GPC1P35052 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GPC1P35052 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPC1P35052 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPC1P35052 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPC1P35052 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GPC1P35052 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPC1P35052 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPC1P35052 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPC1P35052 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPC1P35052 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPC1P35052 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPC1P35052 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPC1P35052 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPC1P35052 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPC1P35052 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPC1P35052 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPC1P35052 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPC1P35052 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPC1P35052 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPC1P35052 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPC1P35052 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPC1P35052 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GPC1P35052 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPC1P35052 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPC1P35052 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPC1P35052 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPC1P35052 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPC1P35052 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPC1P35052 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPC1P35052 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPC1P35052 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPC1P35052 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPC1P35052 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPC1P35052 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPC1P35052 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPC1P35052 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPC1P35052 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPC1P35052 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPC1P35052 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPC1P35052 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPC1P35052 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPC1P35052 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPC1P35052 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPC1P35052 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPC1P35052 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPC1P35052 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPC1P35052 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPC1P35052 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPC1P35052 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPC1P35052 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPC1P35052 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPC1P35052 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GPC1P35052 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPC1P35052 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPC1P35052 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPC1P35052 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPC1P35052 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms