Protein–RNA interactions for Protein: P32314

FOXN2, Forkhead box protein N2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN2P32314 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXN2P32314 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms