Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOBEC3AP31941 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms