Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TSPOP30536 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TSPOP30536 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TSPOP30536 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms