Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA1P29973 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNGA1P29973 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNGA1P29973 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNGA1P29973 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNGA1P29973 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNGA1P29973 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNGA1P29973 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNGA1P29973 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNGA1P29973 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNGA1P29973 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNGA1P29973 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNGA1P29973 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNGA1P29973 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA1P29973 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA1P29973 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA1P29973 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA1P29973 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA1P29973 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA1P29973 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA1P29973 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA1P29973 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA1P29973 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA1P29973 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA1P29973 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA1P29973 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA1P29973 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA1P29973 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms