Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLD1P28340 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLD1P28340 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLD1P28340 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLD1P28340 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLD1P28340 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLD1P28340 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLD1P28340 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLD1P28340 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLD1P28340 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLD1P28340 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLD1P28340 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLD1P28340 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLD1P28340 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLD1P28340 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLD1P28340 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLD1P28340 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLD1P28340 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLD1P28340 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLD1P28340 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLD1P28340 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLD1P28340 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLD1P28340 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLD1P28340 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLD1P28340 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLD1P28340 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLD1P28340 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
POLD1P28340 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLD1P28340 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLD1P28340 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
POLD1P28340 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
POLD1P28340 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
POLD1P28340 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
POLD1P28340 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
POLD1P28340 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLD1P28340 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLD1P28340 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLD1P28340 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLD1P28340 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
POLD1P28340 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLD1P28340 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLD1P28340 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLD1P28340 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLD1P28340 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
POLD1P28340 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLD1P28340 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLD1P28340 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLD1P28340 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLD1P28340 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
POLD1P28340 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLD1P28340 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLD1P28340 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLD1P28340 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLD1P28340 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLD1P28340 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLD1P28340 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLD1P28340 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLD1P28340 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLD1P28340 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLD1P28340 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLD1P28340 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLD1P28340 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLD1P28340 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLD1P28340 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLD1P28340 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLD1P28340 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLD1P28340 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLD1P28340 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLD1P28340 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLD1P28340 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLD1P28340 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLD1P28340 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLD1P28340 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLD1P28340 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLD1P28340 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLD1P28340 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLD1P28340 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLD1P28340 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLD1P28340 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLD1P28340 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLD1P28340 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLD1P28340 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLD1P28340 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLD1P28340 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLD1P28340 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLD1P28340 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLD1P28340 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
POLD1P28340 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
POLD1P28340 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLD1P28340 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLD1P28340 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLD1P28340 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLD1P28340 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLD1P28340 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLD1P28340 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLD1P28340 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLD1P28340 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLD1P28340 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLD1P28340 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLD1P28340 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms