Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2AP24928 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2AP24928 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms