Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNA6P17658 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms