Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP1BBP13224 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms