Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNB1P11230 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms