Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLUP10909 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLUP10909 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLUP10909 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLUP10909 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLUP10909 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLUP10909 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLUP10909 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLUP10909 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLUP10909 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLUP10909 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLUP10909 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLUP10909 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLUP10909 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLUP10909 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLUP10909 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLUP10909 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLUP10909 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLUP10909 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLUP10909 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLUP10909 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLUP10909 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLUP10909 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLUP10909 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLUP10909 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLUP10909 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLUP10909 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLUP10909 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLUP10909 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLUP10909 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLUP10909 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLUP10909 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLUP10909 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLUP10909 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLUP10909 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLUP10909 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLUP10909 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms