Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3P09919 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3P09919 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3P09919 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSF3P09919 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSF3P09919 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSF3P09919 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSF3P09919 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSF3P09919 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSF3P09919 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSF3P09919 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSF3P09919 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSF3P09919 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSF3P09919 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSF3P09919 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSF3P09919 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSF3P09919 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSF3P09919 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSF3P09919 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSF3P09919 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSF3P09919 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSF3P09919 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms