Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG5P05408 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG5P05408 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG5P05408 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG5P05408 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG5P05408 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG5P05408 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG5P05408 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG5P05408 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG5P05408 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG5P05408 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG5P05408 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG5P05408 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG5P05408 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG5P05408 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG5P05408 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG5P05408 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG5P05408 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG5P05408 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG5P05408 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG5P05408 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG5P05408 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG5P05408 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG5P05408 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG5P05408 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG5P05408 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG5P05408 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG5P05408 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG5P05408 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCG5P05408 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCG5P05408 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCG5P05408 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCG5P05408 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCG5P05408 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCG5P05408 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCG5P05408 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCG5P05408 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCG5P05408 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCG5P05408 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SCG5P05408 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG5P05408 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG5P05408 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG5P05408 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG5P05408 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG5P05408 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG5P05408 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG5P05408 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG5P05408 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG5P05408 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG5P05408 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG5P05408 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG5P05408 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG5P05408 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG5P05408 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG5P05408 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCG5P05408 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms