Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYBBP04839 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYBBP04839 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CYBBP04839 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYBBP04839 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYBBP04839 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYBBP04839 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYBBP04839 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYBBP04839 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYBBP04839 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYBBP04839 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYBBP04839 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYBBP04839 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYBBP04839 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CYBBP04839 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYBBP04839 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYBBP04839 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CYBBP04839 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms