Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX58O95786 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX58O95786 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX58O95786 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX58O95786 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX58O95786 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX58O95786 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX58O95786 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX58O95786 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX58O95786 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX58O95786 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX58O95786 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX58O95786 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX58O95786 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX58O95786 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX58O95786 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX58O95786 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX58O95786 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX58O95786 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX58O95786 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX58O95786 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX58O95786 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX58O95786 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX58O95786 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX58O95786 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX58O95786 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX58O95786 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX58O95786 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX58O95786 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX58O95786 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX58O95786 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX58O95786 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX58O95786 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX58O95786 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX58O95786 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX58O95786 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX58O95786 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX58O95786 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms