Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN7O94888 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms