Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLIT2O94813 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIT2O94813 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms