Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJB3O75712 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJB3O75712 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB3O75712 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB3O75712 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB3O75712 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB3O75712 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB3O75712 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB3O75712 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB3O75712 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB3O75712 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB3O75712 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB3O75712 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB3O75712 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB3O75712 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB3O75712 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB3O75712 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB3O75712 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB3O75712 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB3O75712 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB3O75712 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB3O75712 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB3O75712 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB3O75712 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB3O75712 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB3O75712 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB3O75712 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB3O75712 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB3O75712 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB3O75712 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB3O75712 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB3O75712 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB3O75712 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB3O75712 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB3O75712 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms