Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMUO75648 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMUO75648 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMUO75648 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms