Protein–RNA interactions for Protein: O75581

LRP6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP6O75581 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP6O75581 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP6O75581 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP6O75581 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP6O75581 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP6O75581 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP6O75581 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP6O75581 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP6O75581 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP6O75581 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP6O75581 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP6O75581 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP6O75581 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP6O75581 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP6O75581 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP6O75581 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP6O75581 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP6O75581 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP6O75581 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP6O75581 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP6O75581 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP6O75581 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP6O75581 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP6O75581 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP6O75581 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP6O75581 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP6O75581 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP6O75581 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP6O75581 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP6O75581 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP6O75581 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP6O75581 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP6O75581 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP6O75581 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRP6O75581 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRP6O75581 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP6O75581 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP6O75581 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP6O75581 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP6O75581 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP6O75581 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP6O75581 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP6O75581 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP6O75581 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP6O75581 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP6O75581 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP6O75581 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP6O75581 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP6O75581 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP6O75581 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP6O75581 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP6O75581 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP6O75581 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP6O75581 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP6O75581 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP6O75581 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP6O75581 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP6O75581 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP6O75581 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP6O75581 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP6O75581 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP6O75581 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP6O75581 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP6O75581 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP6O75581 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP6O75581 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP6O75581 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP6O75581 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP6O75581 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP6O75581 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP6O75581 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP6O75581 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP6O75581 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP6O75581 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP6O75581 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP6O75581 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP6O75581 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP6O75581 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP6O75581 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP6O75581 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP6O75581 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP6O75581 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP6O75581 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP6O75581 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP6O75581 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP6O75581 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP6O75581 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP6O75581 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP6O75581 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP6O75581 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP6O75581 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP6O75581 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP6O75581 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP6O75581 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP6O75581 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP6O75581 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP6O75581 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms