Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F6O75461 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F6O75461 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F6O75461 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F6O75461 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F6O75461 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F6O75461 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F6O75461 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F6O75461 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F6O75461 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F6O75461 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F6O75461 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F6O75461 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F6O75461 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F6O75461 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F6O75461 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F6O75461 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F6O75461 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F6O75461 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F6O75461 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F6O75461 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F6O75461 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F6O75461 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F6O75461 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F6O75461 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F6O75461 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F6O75461 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F6O75461 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F6O75461 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2F6O75461 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms