Protein–RNA interactions for Protein: O75365

PTP4A3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A3O75365 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTP4A3O75365 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PTP4A3O75365 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PTP4A3O75365 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PTP4A3O75365 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTP4A3O75365 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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