Protein–RNA interactions for Protein: O75177

SS18L1, Calcium-responsive transactivator, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L1O75177 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SS18L1O75177 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms