Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNC1O60486 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNC1O60486 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNC1O60486 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNC1O60486 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNC1O60486 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNC1O60486 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNC1O60486 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNC1O60486 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNC1O60486 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNC1O60486 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNC1O60486 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNC1O60486 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNC1O60486 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNC1O60486 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNC1O60486 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNC1O60486 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNC1O60486 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNC1O60486 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNC1O60486 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNC1O60486 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNC1O60486 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNC1O60486 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNC1O60486 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNC1O60486 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
PLXNC1O60486 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNC1O60486 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms