Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DENRO43583 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DENRO43583 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DENRO43583 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DENRO43583 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DENRO43583 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DENRO43583 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DENRO43583 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DENRO43583 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DENRO43583 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DENRO43583 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DENRO43583 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DENRO43583 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DENRO43583 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DENRO43583 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DENRO43583 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DENRO43583 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DENRO43583 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DENRO43583 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DENRO43583 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DENRO43583 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DENRO43583 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DENRO43583 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DENRO43583 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DENRO43583 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DENRO43583 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DENRO43583 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DENRO43583 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DENRO43583 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DENRO43583 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DENRO43583 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DENRO43583 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DENRO43583 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms