Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF14O43557 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms