Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SMAD6O43541 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms