Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms