Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRTO14522 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRTO14522 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
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