Protein–RNA interactions for Protein: O00512

BCL9, B-cell CLL/lymphoma 9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL9O00512 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL9O00512 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL9O00512 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL9O00512 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL9O00512 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL9O00512 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL9O00512 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL9O00512 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL9O00512 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL9O00512 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL9O00512 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL9O00512 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL9O00512 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL9O00512 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL9O00512 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL9O00512 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL9O00512 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL9O00512 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL9O00512 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL9O00512 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL9O00512 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL9O00512 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCL9O00512 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL9O00512 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL9O00512 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL9O00512 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL9O00512 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL9O00512 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL9O00512 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL9O00512 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL9O00512 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL9O00512 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL9O00512 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL9O00512 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL9O00512 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL9O00512 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL9O00512 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL9O00512 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL9O00512 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL9O00512 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL9O00512 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL9O00512 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL9O00512 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL9O00512 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL9O00512 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL9O00512 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL9O00512 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCL9O00512 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL9O00512 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL9O00512 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL9O00512 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL9O00512 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL9O00512 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL9O00512 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL9O00512 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL9O00512 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL9O00512 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL9O00512 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL9O00512 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL9O00512 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL9O00512 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL9O00512 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL9O00512 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL9O00512 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL9O00512 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL9O00512 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL9O00512 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL9O00512 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL9O00512 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCL9O00512 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCL9O00512 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCL9O00512 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCL9O00512 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCL9O00512 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCL9O00512 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCL9O00512 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCL9O00512 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BCL9O00512 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCL9O00512 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCL9O00512 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BCL9O00512 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCL9O00512 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCL9O00512 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCL9O00512 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCL9O00512 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCL9O00512 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BCL9O00512 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCL9O00512 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCL9O00512 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCL9O00512 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCL9O00512 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCL9O00512 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCL9O00512 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCL9O00512 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCL9O00512 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCL9O00512 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCL9O00512 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCL9O00512 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCL9O00512 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCL9O00512 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms