Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3C2AO00443 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3C2AO00443 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms