Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01387J3KSC0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01387J3KSC0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms