Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCER2I3L3R5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCER2I3L3R5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms