Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NOTOA8MTQ0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms