Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM3

RIMBP3B, RIMS-binding protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3BA6NNM3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RIMBP3BA6NNM3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIMBP3BA6NNM3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIMBP3BA6NNM3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIMBP3BA6NNM3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIMBP3BA6NNM3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIMBP3BA6NNM3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIMBP3BA6NNM3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIMBP3BA6NNM3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIMBP3BA6NNM3 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIMBP3BA6NNM3 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIMBP3BA6NNM3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIMBP3BA6NNM3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RIMBP3BA6NNM3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIMBP3BA6NNM3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RIMBP3BA6NNM3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RIMBP3BA6NNM3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RIMBP3BA6NNM3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms