Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms