Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HELTA6NFD8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms