Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VWA3AA6NCI4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms