Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL33A6NCF5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms