Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNPO3Q9Y5L0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms