Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF6Q9Y4K3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAF6Q9Y4K3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAF6Q9Y4K3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAF6Q9Y4K3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF6Q9Y4K3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF6Q9Y4K3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF6Q9Y4K3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF6Q9Y4K3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF6Q9Y4K3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF6Q9Y4K3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF6Q9Y4K3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAF6Q9Y4K3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms