Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y467

SALL2, Sal-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL2Q9Y467 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SALL2Q9Y467 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms