Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms